TY - JOUR A2 - Huang, Tom Hsun-Wei AU - Sullivan, Holli-Joi AU - Wang, Xiaoyan AU - Nogle, Shaina AU - Liao, Siyan AU - Wu，春PY - 2020 DA - 2020/04/01 TI -探针完全和部分激活人类的过氧物酶体Proliferator-Activated受体通过Pan-Agonist Chiglitazar使用分子动力学模拟SP - 5314187六世- 2020 AB - Chiglitazar是一种很有前途的新一代胰岛素敏化剂较低的反向影响治疗II型糖尿病(T2DM) and has shown activity as a nonselective pan-agonist to the human peroxisome proliferator-activated receptors (PPARs) (i.e., full activation of PPAR γ以及PPAR的部分激活 α和PPAR β/ δ）.然而，它没有高分辨率的ppar复杂结构，其详细的相互作用和激活机制仍不清楚。在这项研究中，我们将chiglitazar连接到三种hPPAR亚型的实验分辨晶体结构PPAR α, PPAR β/ δ, PPAR γ，然后是3 μ每个系统的分子动力学模拟。MM-GBSA结合能计算结果显示，chiglitazar对hPPAR的结合能最大 γ(-144.6千卡/摩尔)，其次是hPPAR α(-138.0千卡/摩尔)和hPPAR β(-135.9 kcal/mol)，顺序与实验数据一致。通过残基分解MM-GBSA结合能，利用二维相互作用图，对每个复杂系统中参与chiglitazar结合的关键残基进行了鉴定和表征。此外，我们详细的动力学分析支持了螺旋12的构象和动力学在决定不同类型配体(例如，完全激动剂和部分激动剂)的活性方面起着关键作用。部分激动剂可以采用更线性的构象和更低的灵活性，而不是完全沿激动剂或拮抗剂构象的方向弯曲。我们的发现可能有助于这种新一代药物的进一步发展。SN - 1687-4757 UR - https://doi.org/10.1155/2020/5314187 DO - 10.1155/2020/5314187