TY -的A2 - Chen Tingtao盟——张,杰盟——苏Lingkai AU -王,元盟-邓,胡舒立PY - 2020 DA - 2020/12/11 TI -改善人类口腔微生物高通量测序:从Illumina公司PacBio SP - 6678872六世- 2020 AB - 背景。全面了解共生的微生物区系及其与健康的关系对预防和打击疾病至关重要。本研究的目的是检查口腔微生物的结构采用不同的测序技术。 材料和方法。五个学龄前儿童没有招募口头和系统性疾病的症状。唾液收集样品。468个基点插入大小图书馆被建在了MiSeq然后受到300 bp paired-end测序平台。库插入较长的尺寸,包括一个完整的16 s rDNA基因测序在PacBio RS II平台。 结果。总共122.6 Mb的原始数据,其中包括244967高质量的序列,MiSeq平台生成的,而134.6 Mb的原始数据,其中包括70030高质量的读取,PacBio RS II平台生成的。集群独特的序列在3%辣子鸡不同导致平均225辣子鸡MiSeq平台;然而,辣子鸡的数量上生成PacBio RS II平台是449年,远远大于辣子鸡MiSeq平台上生成的数量。共有437种10门和60属PacBio RS II平台检测到的,而属于12门72属163种被MiSeq检测平台。 结论。健康中国儿童的口腔微生物区系进行了分析。与传统的16 s rRNA测序技术相比,PacBio系统,尽管提供的干净数据量更低,超过了解决MiSeq平台通过提高读取长度和注释的核苷酸序列物种或应变水平。这个试验是注册 NCT02341352。SN - 1712 - 9532你2020/6678872 / 10.1155——https://doi.org/10.1155/2020/6678872——摩根富林明——加拿大《传染病杂志》上的研究和医学微生物学PB - Hindawi KW - ER