TY - A2的妞妞,Bing AU -郑Zhimin AU -邓,非盟-杨,尾戒缠住Jiansheng PY - 2020 DA - 2020/12/31 TI - 5-Gene签名的识别可以提高肺腺癌预后分层基于入侵的差异表达基因的分子亚型SP - 8832739六世- 2020 AB -
背景。侵入性肿瘤细胞的收购行为被认为是转移级联的基石。因此,与侵袭性相关基因标记可以根据病人的预后分层。在这项研究中,我们旨在识别入侵遗传特征和研究其在肺腺癌的生物相关性。
方法。TCGA 250例肺腺癌患者作为训练集,TCGA剩下的250患者中,500年,TCGA患者,226例GSE31210, 83 GSE30219患者,127例GSE50081被用作验证数据集。亚型分类TCGA的肺腺癌样本是基于使用R包ConsensusClusterPlus invasion-associated基因。kaplan meier曲线,套索(至少绝对收缩和选择算子)方法,单变量和多变量Cox分析用于开发的分子模型预测生存。
结果。结果,两个分子亚型LUAD TCGA被首次发现的所有数据集是重要的生存时间。C1亚型与不良预后具有较高的恶性肿瘤的临床特点,更高的KRAS突变频率和TP53,较低的免疫调节分子的表达。2463个差异表达入侵基因C1和C2亚型之间,其中包括580 upregulation基因差别和1883年对这些基因。功能富集分析发现调节基因与肿瘤的发展途径,而表达下调的基因更与免疫有关。此外,5-invasion基因签名构造基于2463个基因,这是四个数据集进行验证。这个签名将患者分为高风险和低风险组,和柳妲高风险组的生存率明显低于低风险组。多变量Cox分析显示,该基因签名柳妲是一个独立的预后因素。与其他现有的模型相比,我们的模型有更高的AUC。
结论。在这项研究中,两个亚型。此外,我们开发了一个5-gene签名预后风险模型,它具有良好的AUC独立训练集和验证集和是一个模型与独立的临床特点。因此,我们建议使用这个分类器作为分子诊断测试来评估患者的预后风险柳妲。SN - 2314 - 6133你2020/8832739 / 10.1155——https://doi.org/10.1155/2020/8832739——摩根富林明——生物医学研究国际PB - Hindawi KW - ER