sirNA效率:结构或序列-这就是问题

抽象性

RNA干扰生命科学的胜利成功基础是它高超能力按次令基因消沉成功RNAi方法的第一个任务就是识别高度活跃小干扰RNAs早期发现SiRNAs能力大相径庭热动特性影响 siRNA活动时大有进展基于这些参数的设计算法提高生成强效SIRNAs的机会许多SiRNA自设计后无法静默目标基因,而另一些则高效,尽管不符合推荐标准。iRNA绑定网站的无障碍性已被调查为附加参数,这对RNAi中介静默很重要。这些因素和其他因素对RNAi成功方法至关重要,将在本审查中讨论。

引用

1. FEckstein,Small非编码RNAs生化科学趋势,vol.30号8页445-452,2005Viewat:谷歌学者
2. RCCRyther,ASFlynt,JA3Phlips和JGPTON,SiRNA治疗法:小RNA大潜力Gene处理,vol.12号公元前1页5-11,2005年Viewat:谷歌学者
3. grünweller和RK Hartmann,“RNA干扰对分子医学以基因专用方法处理”,当前医学化学,vol.12号26页3143-3161,2005年Viewat:谷歌学者
4. SDJayasena设计师iRNAs 克服自然过程失窃挑战RNAi和Gene静默杂志,vol.2号公元前1页109-117,2006Viewat:谷歌学者
5. IJMacrae,KZULLI等,“二叉式RNA二叉处理结构基础 Dicer”,科学类,vol.311号5758页195-198,2006年Viewat:谷歌学者
6. s M Elbashir、Jbortth、W Lendeckel、AYalcin、KWeber和TTuss性质,vol.411号6836页494-498,2001Viewat:谷歌学者
7. J-RBertrand、MPottier、AVekris、POLON、A Maksimenko和CMLVYA,“细胞文化中和Vi生物化学和生物物理研究通信,vol.296号4页1000-1004,2002Viewat:谷歌学者
8. grunweller,EWyszko,BBiber,RJHNELLEVAERDmann和JKurreck比较哺乳动物细胞使用锁核酸、2'O-MetRNA、磷化物小干扰RNA的不同抗振策略核酸研究,vol.31号12页3185-3193,2003Viewat:谷歌学者
9. Miyagishi,M Hayashi和KTaira比较抗生素核素和SiRNA对哺乳动物细胞相同目标的抑制效果抗衡和核酸药开发,vol.13号公元前1页2003年1-7Viewat:谷歌学者
10. RKM Leung和PWittaker,RNA干扰:从基因静默到基因专用治疗方法药理学和治疗学,vol.107号2页222-239,2005年Viewat:谷歌学者
11. msioud和POIVEREN,“Ribozymes、DNzymes和小干扰RNAs治疗学”,当前毒品目标,vol.6号6页647-653,2005年Viewat:谷歌学者
12. P Shankar,N Manjunath和J Lieberman,“使用RNA干扰静默疾病的前景”,美国医学协会杂志,vol.293号11页1367-1373,2005年Viewat:谷歌学者
13. SUprichard,RNA干扰的治疗潜力FEBS字母,vol.579号26页5996-6007,2005年Viewat:谷歌学者
14. VAmbros,动物微机函数性质,vol.431号7006页350-355,2004年Viewat:谷歌学者
15. Castein,“自然产生异常性”,自然生物技术,vol.19号8页737-738,2001Viewat:谷歌学者
16. THolen、MAMZUIEGEGEGIGEREEBAE和HPrydz,“短干扰RNA对人凝聚触发TIGE核酸研究,vol.30号8页1757-1766,2002Viewat:谷歌学者
17. s M Elbashir、Jbortth、KWeber和TTuschl,“使用小干扰RNA对人工哺乳细胞中的基因函数剖析”。方法论,vol.26号2页99-213,2002年Viewat:谷歌学者
18. kvorova、A Reynolds和SDJayase单元格内,vol.115号2页209-216,2003Viewat:谷歌学者
19. schwarz、Ghutvágner、Tdu、Zsu、Naronin和PDZamore,“RNAi酶综合体汇编对称性”。单元格内,vol.115号2页99-208,2003年Viewat:谷歌学者
20. Reynolds、Dleake、Quese、S Sscringe、Wsssshall和Khvora都称RNA逻辑设计干扰自然生物技术,vol.22号3页326-330,2004年Viewat:谷歌学者
21. KUi-Tei,Y Naito,FTakahashi等,“选择高效SiRNA序列用于哺乳动物和小鸡RNA干扰指南”,核酸研究,vol.32号3页936-948,2004年Viewat:谷歌学者
22. mAmarzguioui和HPrydz,“iRNA函数序列选择算法”,生物化学和生物物理研究通信,vol.316号4页1050-1058,2004年Viewat:谷歌学者
23. Mchalk,CWahlesstedt和ELSonnhammer,“提高并自动化预测iRNA有效效果”,生物化学和生物物理研究通信,vol.319号公元前1页264-274,2004Viewat:谷歌学者
24. Huesken,J Lange,CMickanin等编程使用人工神经网络设计全基因组siRNA库自然生物技术,vol.23号8页995-1001,2005年Viewat:谷歌学者
25. G Hutvagner,“SmallRNA RNAi非对称性:RISC汇编和基因调控函数”,FEBS字母,vol.579号26页5850-5857,2005年Viewat:谷歌学者
26. JLiu,MA卡梅尔,FVRivas等,“Argotaute2是哺乳动物RNAi的催化引擎”,科学类,vol.305号5689页1437-1441,2004年Viewat:谷歌学者
27. J-J Song、SKSmith、GJHANONO和LJoshua-TOR,“ARGOATE星际结构及其对RISC切片器活动的影响”,科学类,vol.305号5689页1434-1437,2004年Viewat:谷歌学者
28. FVRivas,NHTolia,JJSong等自然构造和分子生物,vol.12号4页340-349,2005年Viewat:谷歌学者
29. Tomari、CMatranga、BHAYEYNDINETERS和PDZAMERE科学类,vol.306号5700页1377-1380,2004年Viewat:谷歌学者
30. TP Chendrimada、RIGregory、E Kumaraswamy等,“TRBP从Dicer综合体招聘到Ago2处理和基因静默”,性质,vol.436号7051页740-744,2005年Viewat:谷歌学者
31. R I Gregory,TP Chendrimata,NCooch和R Shiekhattar,“人类RISC夫妇微数RNA生物生成和后写基因静默”,单元格内,vol.123号4页631-640,2005年Viewat:谷歌学者
32. Matranga,Y tomari,C Shin,DPBartel和PDZamore,单元格内,vol.123号4页607-620,2005年Viewat:谷歌学者
33. TRand、SPetsen、FDU和XWang,“ARgotaute2在RISC激活期间切除SiRNA反制片段”,单元格内,vol.123号4页621-629,2005年Viewat:谷歌学者
34. Kretschmer-Kazemi Far和GSczaiel,“SiRNA活动与结构目标无障碍性相关:与抗生素单片比较”,核酸研究,vol.31号15页4417-4424,2003Viewat:谷歌学者
35. ea Bohula,A J Salisbury,M Sohail et al.,“IGF1R转录中的二级结构对面向1类胰岛素相似生长因子受体(IGF1R)的小型干扰RNA效果产生影响”。生物化学杂志,vol.278号18页15991-15997,2003年Viewat:谷歌学者
36. Ta Vickers、Skoo、CFBennett、STcroke、NM Dean和BFBBFBCARCE,“小干扰RNA和RNAS依赖抗感代理生物化学杂志,vol.278号9页7108-7118,2003Viewat:谷歌学者
37. KQLO和DCChang,“SiRNA基因屏蔽效率强烈依赖目标区域MRNA局部结构”,生物化学和生物物理研究通信,vol.318号公元前1页303-310,2004年Viewat:谷歌学者
38. KYoshinari Miyagishi和KTaira写道:“对RNAi作用目标区域紧凑结构、序列和位置”,核酸研究,vol.32号2页691-699,2004年Viewat:谷歌学者
39. mOverhoff,M Alken,RKretschmer-Kazemi Far等,“本地RNA目标结构影响siRNA效果:系统化全局分析”,分子生物学杂志,vol.348号4页871-881,2005年Viewat:谷歌学者
40. KMBrown Cy-YCU和TMRA自然构造和分子生物,vol.12号5页469-470,2005年Viewat:谷歌学者
41. shubert,Agrnweller,VAErdmann和JKurreck,“本地RNA目标结构影响siRNA效果:系统分析刻意设计绑定区”,分子生物学杂志,vol.348号4页883-893,2005年Viewat:谷歌学者
42. J Wilson,S Jayasena,Akvorova等,“RNA干扰人类肝细胞传播的肝炎C美利坚合众国国家科学院记录,vol.100号5页2783-2788,2003Viewat:谷歌学者
43. KMPhipps、A Martinez、JLU、BAHEINZ和GZHO,“小干扰RNA分子作为潜在的反人类犀牛病毒代理物:体能、特性和机制性”,反病毒研究,vol.61号公元前1页49-55,2004年Viewat:谷歌学者
44. DWERKTSCHUBETVLINDIG等,“开发有效RNA抗+strandRNA病毒策略:封存coxackie病毒B3及其coxackie病毒-deno病毒接收器”,生物化学,vol.386号9页857-863,2005年Viewat:谷歌学者
45. Shubert、H-PGrunert、HZeichhardt、DWerk、VAErdmann和JKurreck分子生物学杂志,vol.346号2页457-465,2005年Viewat:谷歌学者
46. J元PKM长片大片大片大片区和DYang小片区使用小干扰RNA复制Coxsackie病毒B3需要完全序列匹配病毒正片中心区病毒学杂志,vol.79号4页2151-2159,2005年Viewat:谷歌学者
47. YDing,CYCEN和CELawrence,“Sform web服务器用于核酸统计折叠和合理设计”,核酸研究,vol.32号web服务器问题,ppW135-W141,2004年Viewat:谷歌学者
48. sirNA设计包括二级结构目标预测自然方法,vol.2号8页2-2,2005年应用注解Viewat:谷歌学者
49. V Patzel、S Rutz、I Dietrich、Ckberle、A Scheffold和SHE Kaufmann,“SiRNAs设计生成非结构化指南-RNAs提高RNA干扰效率自然生物技术,vol.23号11页1440-1444,2005年Viewat:谷歌学者
50. R Kittler,G Putz,LPelletier等,“单词编译siRNA屏幕识别细胞分片必不可缺的基因”,性质,vol.432号7020页1036-1040,2004年Viewat:谷歌学者
51. D-H Kim、MABELKE、SDROS、MS昌、SCUI和JJRSI自然生物技术,vol.23号2页222-2262005Viewat:谷歌学者
52. siolass,CLERNER,JBurchard等,“合成shRNAs像强RNAi触发器自然生物技术,vol.23号2页227-231,2005年Viewat:谷歌学者
53. sdrose,D-H Kim,M Amarzguioui等核酸研究,vol.33号13页4140-4156,2005年Viewat:谷歌学者
54. FStegmeier、Ghu、RJRKles、GJHANONETERS和SJELETGEGERGEGEDERGEDERSULASULA美利坚合众国国家科学院记录,vol.102号37页13212-13217,2005年Viewat:谷歌学者
55. JMSilva,MZLI,K Chang et al.,“第二代SHRNA库覆盖鼠标和人类基因组”,自然遗传学,vol.37号11页1281-1288,2005年Viewat:谷歌学者
56. P Sandy Ventura和T Jacks,“mamalianRNAi实用指南”,生物技术,vol.三十九号2页215-224,2005Viewat:谷歌学者

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