古细菌

海草定殖通过沉积海草纤维和从根部释放有机碳和氧来改变沉积物的物理化学性质。这种由海草定殖引起的空间异质性是如何影响古生物群落结构和丰富度的尚不清楚。在这项研究中，我们调查了该地区植被和邻近裸露地表沉积物中的古细菌丰度、多样性和成分佐斯特拉码头草地。16srdna的高通量测序表明韦塞尔乔塔,巴哈叶塔，和塔乌马尔切奥塔是所有样本中最丰富的门，分别占整个古生物群落的42%、21%和17%。就相对丰度而言，韦塞尔乔塔和巴哈叶塔这两个生态位之间没有显著差异；但是，特定的亚类（Woese-3、Woese-21、Bathy-6、Bathy-18）在植被沉积物中显著富集( ),虽然塔乌马尔切奥塔在未经筛选的网站中受到青睐( ).对古菌16srrna基因的定量分析表明，整个古菌群落的绝对丰度，巴哈叶塔，在植被沉积物中，Woese-3、Woese-10、Woese-13和Woese-21的含量明显高于裸露沉积物( ).我们的研究扩展了对海草系统中古生菌的分布模式和生态位偏好的现有知识，特别是对不同的亚类韦塞尔乔塔和巴哈叶塔，无论是相对比例还是绝对数量。

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接种源在废水厌氧处理中起着至关重要的作用。脂质存在于各种废水中，具有很高的产甲烷潜力，但它们的水解会产生对厌氧微生物有抑制作用的长链脂肪酸（LCFAs）。在中温和高温条件下，对含LCFA废水厌氧处理接种物进行了筛选。然而，目前还没有对含LCFA废水生产甲烷的接种剂进行低温评价，需要进行。在这项研究中，我们评估了三种接种物（一种颗粒污泥和两种城市消化池污泥）在低温（10和20°C）下从含LCFA的合成乳品废水（SDW）中产生甲烷的能力。甲烷产量（基于mL-CH_4个/化学需氧量_补充)使用未驯化的颗粒污泥在10天内达到86-65%的乙酸盐和45-20%的SDW，而城市消化池污泥仅在20°C时产生甲烷，即使在200天的培养后，也不会在10°C时产生甲烷。结果发现，在低温下，接种体中的乙酰营养活性对LCFA产生甲烷至关重要，这突出了甲烷菌（古乙酰基）在低温下。家族中细菌类群的存在互营菌科(同营养结果表明，接种物中未培养的类群对SDW在10℃下产甲烷具有重要意义。本研究建议通过高通量扩增测序法评估乙酰乙酸活性和初始微生物群落特征，以选择低温（10℃以下）产甲烷的接种物含油脂的废水。

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微生物很好地适应了它们的栖息地，但对其他有机体分泌的有毒代谢物或非生物化合物或在各自环境条件下形成的化学物质部分敏感。嗜热菌受到焦谷氨酸的挑战，焦谷氨酸是一种内酰胺，在需氧嗜热条件下由谷氨酸环化自发形成。众所周知，嗜热嗜酸crenarchaeon的生长水飞糖浆（以前硫矿硫化叶菌)被焦谷氨酸完全抑制。在本研究中，我们研究了焦谷氨酸对S、 索尔法塔里科斯和密切相关的克雷纳查恩酸黄杨。与…对比S、 索尔法塔里科斯,S、 酸杆菌以焦谷氨酸为唯一碳源成功培养。生物信息学分析表明硫杆菌科至少有一个5-氧丙烷酶的候选酶，该酶催化焦谷氨酸到谷氨酸的ATP依赖性转化。在S、 索尔法塔里科斯我们观察到焦谷氨酸在细胞内的积累，而粗细胞提取液显示焦谷氨酸的降解效率较低。显然地，S、 酸杆菌似乎在碳水化合物方面没有那么多用途，与之相比更喜欢肽溶性生长S、 索尔法塔里科斯. 总之，S、 酸杆菌显示出焦谷氨酸的更有效利用，并且不受该化合物的抑制，使其成为在高温下与含谷氨酸介质一起应用的更好的候选者。

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关于形成中太平洋海底古生物群落的环境条件的资料有限。本研究旨在探讨太平洋深海沉积物中整个和潜在活跃古生物群落的多样性、组成和功能。为此，沿中太平洋180°子午线采集了沉积物样品。以古菌16srrna基因和转录本为靶点，用Illumina标记测序法评估群落组成和多样性。古生物群落以念珠菌为主亚硝基苯酚(塔乌马尔切奥塔)以及亚硝普胺(塔乌马尔切奥塔)，但海洋组II的相对丰度较高(广域古菌界)与整个古生物群落相比，在活动中观察到。整个和活跃的古生物群落的组成与初级生产力（叶绿素含量）密切相关，解释了40%以上的变异。此外，我们发现整个古生物群落的组成与纬度和硅酸含量有很强的相关性，而活跃的群落与初级生产力和氧化铁含量有显著的相关性。我们从16srrna数据中预测功能剖面来评估古生物群落功能。纬度与整个群落的功能剖面显著相关，而活跃群落的功能剖面与硝酸盐和叶绿素含量显著相关。本研究的结果首次揭示了太平洋底栖古生物群落和影响其多样性、分布和功能的环境条件。此外，它们还可以作为进一步研究深海沉积物中的古细菌的模板。

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描述了一个能有效合成蛋白质的系统体外在高温下。它是基于未分离的细胞裂解物（S30）的使用硫矿硫化叶菌以前在我们的实验室很好地用于翻译预翻译的mrna，现在已经适应于执行耦合转录和翻译。在这个表达系统中，重要的元素是一个来自S、 索尔法塔里科斯16S/23srrna编码基因，从中可以高效地转录出特异的mrna。报道了两种不同蛋白质的合成，包括S、 索尔法塔里科斯DNA烷基鸟嘌呤DNA烷基转移酶蛋白(党卫军它被证明成功地用适当的荧光底物标记，并在细胞提取物中可视化。实验过程的简单性和蛋白质的比活性为研究蛋白质的结构-功能关系提供了许多可能。

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塞拉多生物群落与巴西的广大地区相对应，被认为是生物多样性的热点。频繁的火灾是这个生物群落的自然特征，对植被结构和组成有影响。然而，持续的人为活动正在促进火灾频率和季节性的变化。尽管Cerrado生物多样性很高，但人们对其微生物群知之甚少，很少有出版物描述在这个生物群中发现的细菌和真菌群落的某些方面，几乎没有关于古细菌的参考文献。在这项研究中，我们描述了塞拉多的古生物多样性严格意义土壤，用16srrna和阿莫阿基因作为分子标记。几乎所有来自两个研究区域的16srrna序列都与I.1b和1.1c相关塔乌马尔切奥塔，通常在陆地环境中检测到的组。尽管研究区域之间的古菌16srrna丰富度和多样性没有显著的统计学差异，但在经常烧伤的区域中发现了较高的I.1b thaumarcheal亚群的相对丰度。许多氨氧化古菌（AOA）都属于这一类，这与阿莫阿在定期燃烧的区域检测到的多样性和OTU数。综上所述，我们的研究结果表明，尽管在调查条件下，古生物群落的总体丰富度和多样性似乎没有太大的差异，但频繁火灾引起的森林覆盖和植被结构的变化可能会对Cerrado土壤的AOA多样性造成长期影响。

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