血统的家庭1与JLNS有关。一种新型复合杂合的突变,c.1741A > T / c。477 + 5 g >家庭成员1-II-1被发现。家庭成员1-I-1和家庭成员1-I-2杂合的运营商。所示的渊源者是黑色和黑色箭头所示。WT:野生型。
2.2。临床评估
执行一系列的听力学评估的渊源者1-II-1,其中包括耳镜检查的检查,条件发挥听力测定(CPA),听觉脑干反应(ABR),听觉稳态诱发反应(ASSR),听觉导抗和畸变产物耳声发射(DPOAE)。孩子也经历了心电图(ECG)和成像测试(计算机断层扫描、CT和磁共振成像MRI)。根据Jervell Lange-Nielsen综合症更新2017年GeneReviews JLNS的诊断建立了深刻的先天性感音神经性耳聋和间隔长高职院校学前教育专业(> 500毫秒)。识别biallelic致病性变异KCNQ1或KCNE1证实诊断(
1]。世界卫生组织(世卫组织,1991年)听力障碍(HI)级系统包括五个等级:没有损伤,≤25 dB nHL;温和,26-40 dB nHL;温和,41-60 dB nHL;严重,61 - 80分贝nHL;深刻,≥81 dB nHL;听力测定的dB nHL(国际标准化组织ISO)值是平均值的值为500,1000,2000,4000 Hz更好的耳朵(
17]。
2.3。基因检测
书面知情同意了全家合送的。大约5毫升静脉血外围收集从三名家庭成员耳聋面板测序/门店和Sanger测序由华大基因研究院基因组学(武汉,中国)。下列实验,血液样本的基因组DNA提取根据制造商的标准程序QIAamp DNA血液Midi设备(试剂盒Inc ., 51185年瓦伦西亚、钙、美国),然后由Covaris片段DNA LE220(麻萨诸塞州,美国)。支离破碎的DNA(200 - 250个基点)是用于生成repair-end图书馆根据Illumina公司协议。有针对性的DNA片段都被SeqCap易之选(罗氏,麦迪逊,美国),其次是postcapture放大。bgiseq - 500平台上的产品排序使用bgiseq - 500 rs高通量测序工具包(PN: 85-05238-01, BGI)。SeqCap EZ选择旨在涵盖所有外显子一起侧翼外显子和内含子边界(±15 bp)的127个已知deafness-related核基因和线粒体deafness-related地区。Postsequencing,一些不合格的序列被从主数据使用一个本地动态规划算法。然后,过滤干净的读取是对齐的基因组参考财团人类基因组构建37 (GRCh37) /人类基因组构建19 (hg19) BWA Multi-Vision软件包(洞穴Wheeler对准器)。对齐后,单核苷酸变异(SNVs)和插入和删除(InDels)被称为SOAPsnp软件和Samtools。 All variants were further filtered and estimated via multiple databases including National Center for Biotechnology Information (NCBI) (
https://www.ncbi.nlm.nih.gov),1000基因组(
http://phase3browser.1000genomes.org/index.html)、核苷酸多态性(dbSNP) (
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/projects/SNP/),HGMD (
http://www.hgmd.cf.ac.uk/ac/index.php)。致病性变异评估在美国大学医学遗传学和分子病理学Genomics-Association (ACMG-AMP)的指导方针。筛选候选人变体经常规Sanger测序方法。我们以前使用的方法发表(
18]。完整的核苷酸和氨基酸序列
KCNQ1基因显示在NCBI (
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/gene/)。
3所示。结果3.1。临床数据
测试结果的渊源者1-II-1如下。CPA显示响应的90分贝nHL在250赫兹(左耳)和没有反应的耳朵在剩下的频率(图
2(一个))。双边tympanograms类型a没有波ABR可以在105分贝nHL引发双边(数据没有显示)。DPOAEs缺席在两个耳朵(数据未显示)。ASSR的阈值是100分贝nHL在500赫兹,100分贝nHL 1千赫(左耳),在500赫兹和90 dB nHL, 95分贝nHL 1千赫(右耳)。助听器后安装,注册会计师揭露响应80分贝nHL的双耳(图250 Hz
2 (b))。CI是植入正确的颞骨。CI手术三个月后,平均听力测定的值的频率为45.8 dB nHL(图
2 (c))。心电图检测长QT间隔(:QT /高职院校学前教育专业480/523毫秒),穹顶和飞镖T波前在V3 CI手术(图
3(一个))。手术结束后,心电图T波变化和T波令展出(两个),和QT间隔628/661毫秒(图/高职院校学前教育专业
3 (b))。影像学(CT)和磁共振)显示没有异常。
使用耳聋面板测序,我们排除在外
KCNE1基因突变的原因被确认为JLNS,发现一种新型复合杂合的突变c.1741A > T / c。477 + 5 g >
KCNQ1基因的渊源者1-II-1(图
4)。c。1741A>T (p.K581X) was a novel mutation, and the c.477+5G>A (IVS2+5G>A) has been reported [
15,
19]。突变c。1741A>T was a nonsense mutation with substitution of no. 1741 nucleotide from adenine to thymine (Figure
4)。它发生在第15外显子(图
5)。c。477+5G>A occurred in intron 2 with a mutation of no. 477+5 nucleotide from guanine to adenine (Figures
4和
5)。这是一个拼接突变。两种突变没有多态的网站,他们于1000年0基因组的患病率。突变p。K581X不是dbSNP和尚未上市的报道。IVS2 + 5 g >已经记录在HGMD [
15),其RS在dbSNP rs397508111数量。孩子的父母都是杂合的航空公司(图
1)。根据2015年美国大学医学遗传学和分子病理学Genomics-Association (ACMG-AMP)指南
20.和2017年细化
21],c的变体。1741A>T (p.K581X) was likely pathogenic, and the variant c.477+5G>A (IVS2+5G>A) was pathogenic.
突变
KCNQ1序列的识别c。1741 c > T(上图)。477+5G>A (below) variant. The mutated nucleotide is shown in red. Red “stop” indicates termination of synthesis. I: boundary of corresponding exon and intron. Red arrows and black rounds: sites of nucleotide changes.
分子基础的情况下JLNS是详细的在基因和蛋白质水平和保护氨基酸的进化领域无义突变的影响。(一)原理图16 biallelic 15外显子和内含子编码
KCNQ1基因(
KCNQ1;000218.3 NM)。两个变量是由箭头表示。小说突变所示所示黑色。红色和已知的变异矩形:外显子。线:基因内区。(b)原理图
α亚基由biallelic IKS次方的编码
KCNQ1基因(
KCNQ1;NM_000218.3) p的致病突变。K581X(红十字会)或IVS2 + 5 g >(蓝色矩形)。六个跨膜段(S1-S6)是由灰色的列,表示pore-loop位于S5和S6之间。绿色的椭圆形:一个域。红色箭头:小说突变。黑色箭头:之前报道的突变。(c)进化的保护域(头,链接器,和尾巴)。突变的网站是由星号表示。灰色残留无法翻译。 Different residues were indicated in blue.
4所示。讨论
一种新型复合杂合的突变c.1741A > T / c。477 + 5 g >
KCNQ1基因被发现在渊源者1-II-1with JLNS。结合病史和听觉的考试的结果,家庭成员1-II-1被诊断出深刻的先天性感音神经性耳聋根据2018年的国际共识(图标)在儿童听力损失的听力学评估(
22)和WHO-HI等级系统。的孩子通过NHS OAE-based测试;我们推测,这是因为毛细胞的功能是在出生时不受影响。据报道,Casimiro等人
kcnq1- / -老鼠在出生时表现出正常毛细胞形态学和延迟毛细胞丢失(
12]。间隔在男性< 440毫秒(普通高职院校学前教育专业
1]。心电图检测间隔延长高职院校学前教育专业(523毫秒)患者人工耳蜗植入术前(图
3)。因此,渊源者1-II-1被诊断出患有JLNS根据上面的诊断标准。据报道,突变的
KCNQ1和
KCNE1基因的原因JLNS [
1,
2]。我们使用门店+ Sanger测序识别病人的基因型。基因检测结果显示
KCNE1基因突变是排除在外。和两个突变
KCNQ1基因,c。1741A>T (p.K581X) and c.477+5G>A (IVS2+5G>A) were identified in the family (Figure
1)。p的变体。K581X小说,而另一个IVS2 + 5 g >是已知的。IVS2 + 5 g >报道影响的个人与LQTS或延长QT间隔
15,
23,
24]。这变种也被确认与p复合杂合的。Y171X JLNS患者(
19]。研究评估意义不明的变体LQTS透露,IVS2 + 5 g >载体有一个长时间间隔进行了运动压力[end-recovery高职院校学前教育专业
25]。Millat等人提出了“双倍剂量”效应,多个或复合基因突变发生在LQTS家庭可能会导致更严重的临床表型
23]。这可以解释个体共享相同的单一突变IVS2 + 5 g >但有不同程度症状(任何症状,只有长QT间隔与心脏事件,与深刻的耳聋(
15,
19,
23,
25])。根据ACMG-AMP标准及其细化,变体IVS2 + 5 g >是致病性。在这里,我们发现IVS2 + 5 g >复合杂合的p。在渊源者K581X 1-II-1(图
1)。小说的氨基酸残基突变网站(p.K581X)在不同的物种(图是高度保守的
5 (c))。通过多个数据库,通过过滤和估计突变p。K581X并不是一个多态的网站,而不是1000年上市的基因组。p。K581X被判断为有可能致病变种ACMG标准。和父母的渊源者1-II-1没有耳聋(图都是杂合的运营商
1)。这些都表明,复合杂合的突变p。K581X / IVS2 + 5 g >可能有“双倍剂量”效应导致JLNS的发病机理。