GRP 消化内科的研究与实践 1687-630X 1687 - 6121 Hindawi出版公司公司 898276 10.1155 /八十九万八千二百七十六分之二千〇一十二 898276 临床研究 多重PCR快速尿素酶试验中的检测比较 幽门螺旋杆菌在质子泵抑制剂的患者 托马斯 1 相文 2 H。 2 曾荫权 丽贝卡W. 3 曾荫权 达健 4 凯特 维克拉姆 1 伊利诺伊州的医学大学芝加哥分校的学院 1853年西波尔克街 芝加哥 伊尔60612 美国 uic.edu 2 TZAM诊断LLC 1824威尔梅特大道 威尔梅特,IL 60091 美国 3 医学系,洛约拉大学医院 梅伍德 IL 60153 美国 luhs.org 4 消化内科,北岸大学健康系统 芝加哥大学 伊利诺斯州,Glenview 60026 美国 uchicago.edu 2012 23 12 2012 2012 08 07 2012 21 11 2012 2012 ©2012托马斯·陈等人。 这是知识共享署名许可,允许在任何媒体不受限制地使用,分发和复制下发布的开放式访问文章,提供原工作正确引用。

背景。进行该研究以评估多重PCR测定的诊断价值,以检测 幽门螺旋杆菌感染和进一步评估对患者和无PPI治疗从CLOtest的负面结果。方法。这项研究是一项回顾性队列,包括457例消化不良症状,谁在埃文斯顿和格兰布鲁克北岸医院行胃镜检查,从2003年6月2007年10月,共有556个样品均具有多个测试在时间有些患者期。的CLOtest的首先执行对胃标本,并从该样品中,分离DNA和单步多重PCR进行。 结果。通过M-PCR检测 幽门螺杆菌在对照组274例中有143例(52.2%),在282例接受PPI治疗的患者中有130例(46.1%)( P = 0.1746 )。CLOtest检测到…的存在 幽门螺旋杆菌在来自相同组的组不服用PPI接收274例治疗PPI和29(10.6%)282案件4(1.4%)( P 0.0001 )。 结论。我们的PCR是足够灵敏检测的存在 幽门螺旋杆菌尽管是在PPI治疗。

1。目的

幽门螺杆菌 幽门螺旋杆菌)是一种螺旋形细菌,主要见于胃内 1]。这种细菌在胃炎显著致病作用,胃癌,胃黏膜相关淋巴组织淋巴瘤和消化性溃疡病[ 2]。世界卫生组织进行分类 幽门螺旋杆菌作为第一类致癌物[ 3]。这是一个大问题,因为世界人口的大约一半被感染 幽门螺旋杆菌[ 4]。

目前,有可用于识别重重考验 幽门螺旋杆菌,但没有金标准。快速尿素酶试验(RUT)被广泛应用于临床检测的脲酶 幽门螺旋杆菌胃粘膜活检。脲酶酶水解尿素成二氧化碳和氨允许 幽门螺旋杆菌在酸性介质中的生存[ 2]。人们普遍认为,酸还原的药物,特别是质子泵抑制剂(PPI),通过减少的量降低RUT,尿素呼吸试验,组织学,和粪便抗原检测的灵敏度和准确度 幽门螺旋杆菌[ 6 7]。

质子泵抑制剂降低的活性 幽门螺旋杆菌在胃中和近侧移位它们的分布。所以建议质子泵抑制剂抑制其生长 幽门螺旋杆菌通过pH依赖性机制。质子泵抑制剂可以在诊断试验导致假阴性和执行测试[之前应停止至少2-4周 8 9]。然而,由于PPI撤退是强烈症状复发有关这会产生一个问题。而在PPI,负RUT不足以排除感染。活检标本可能含有活细胞的低细菌密度,得到了否定的结果。这将成为一个问题,因为很多美国人正在服用这些药物。2009年,生产者价格指数在美国的销售和第六,对处方的总数分配排在第三位[ 10]。在一些研究中,作者得出结论,质子泵抑制剂减少车辙和组织学检查胃窦和胃体活检的敏感性和特异性。聚合酶链反应(PCR)是在检测更灵敏 幽门螺旋杆菌。Yakoob等。结果表明,PCR比患者服用质子泵抑制剂[RUT和组织学更敏感 7 11 12]。然而,单基因PCR的问题仍然达不到理想的特异性和误报。有了问题,酸,减少药物引起的许多诊断测试 幽门螺旋杆菌,DNA,和当前的PCR方法测试对于1个或2个基因的突变率,我们开发了一种独特的多重PCR(M-PCR)检测5个独特的基因,提高了特异性。

在先前的研究中,我们进行了,我们独特的M-PCR准确地识别 幽门螺旋杆菌相比RUT和免疫组织化学分析;除了标识的显著数 幽门螺旋杆菌这将不是由前者方法[被检测感染 13- 15]。本研究的目的是确定质子泵抑制剂对RUT和M-PCR的结果的影响。我们推测,M-PCR将不会受到从质子泵抑制剂的生理变化而受到影响,由于M-PCR技术和DNA的稳定性的灵敏度。

2.方法 2.1。病人

这项研究是一项回顾性队列,包括457例消化不良症状,谁在和埃文斯顿西北格兰布鲁克医院行胃镜检查,从2003年6月至2007年10月在活检胃窦部和身体拍摄。该研究分为基础上,全面图审查两组:第一组是在PPI和对照组是不是在PPI至少四个星期。那些服用^ h2受体内窥镜前的过去的4个星期内拮抗剂和抗生素被排除在这两个群体。每位患者的知情同意,并研究审议并通过了埃文斯顿西北医疗保健机构审查委员会批准。

2.2。快速脲酶试验(凝血试验)

该CLOtest的快速尿素酶试验(金佰利,罗斯威尔,GA,USA)根据制造商的说明书上的所有标本胃首先执行。一个明确的洋红色被要求阅读测试为阳性。结果24小时后,20分钟后解释,然后。

2.3。多重PCR

的CLOtest的读取后,将相同的样品送到实验室的DNA分离。然后一步法M-PCR进行。研究者评估M-PCR电泳凝胶失明的CLOtest的结果。所述M-PCR靶向下列基因座:0.86-kb的DNA片段,脲酶A基因,16S核糖体RNA,26-kDa蛋白抗原,和全长hpaA基因。对于每个基因座,一种正向引物,所述通用引物(FC),和两个反向引物(R1和R2)被选择。R2引物位于R1的放大区域的内侧。R1和R2引物,具有五个FC引物,分别混合,在FC-R1和FC-R2引物的两个单独的扩增系统设定(图 1)。共有10个DNA片段可被扩增,在2管,每个含有5个扩增子内部到另一个。对于M-PCR,我们定义了一个积极的情况下, 幽门螺旋杆菌如果来自相同基因座中的10个片段的5个或两套DNA片段被因为细菌的DNA序列的高度多样性的扩增(图 2 13- 16]。在每一个M-PCR运行,正(菌株J99)和负(水空白)对照样品测定,以保证有一个参考,没有污染。每个M-PCR进行包含包含除胃组织所有反应组分以评估污染的阴性对照。此外,三个物理上独立的工作场所都设立了模板制备,PCR反应和PCR后分析,以避免污染。特殊的防回吸吸头和日常紫外线和酒精消毒使用。

图的设计,每个位点的引物。FC,正向引物是通用引物;R1和R2是对反向引物。扩增子FCR1和FC-R 2选自每个基因座扩增。

五对来自5扩增的DNA条带的针对特定基因位点 幽门螺杆菌

2.4。统计分析

所使用的统计软件包是图InStat的版本3.10。通过使用Fisher精确检验,双尾进行统计分析。 P小于0.05为显著性。

3.结果

总共556米的样品均具有超过在其中所收集的数据的时间间隔超过一个测试一些病人。一个postclinical备案审查指出,有地方人服用PPI内镜检查之前至少四周282(50.7%)的情况下。

有由M-PCR测试了两组之间没有差异。通过M-PCR检测, 幽门螺旋杆菌在对照组274例中有143例(52.2%),在282例接受PPI治疗的患者中有130例(46.1%)( P = 0.1746 )。CLOtest检测到…的存在 幽门螺旋杆菌在来自相同组的组不服用PPI接收274例治疗PPI和29(10.6%)282案件4(1.4%)( P 0.0001 )。该M-PCR鉴定 幽门螺旋杆菌在从CLOtest的34例33(97.1%)(表 1)。

M-PCR和CLOtest的区别。

在PPI 如果没有PPI P价值
ñ = 282
CLOtest的
 Positive 4(1.4) 29 (10.6) <0.0001
 Negative 278(98.6) 245(89.4)
M-PCR
 Positive 130(46.1) 143(52.2) 0.1746
 Negative 152(53.9) 131 (47.8)

在这两种PPI和无PPI组,有一个在CLOtest的和M-PCR之间检测率显著差异( P 0.0001 )。的523箱子附加241(46.1%)是由M-PCR那名CLOtest的负检测。具体地,PPI组中,检测到127附加箱子出的278(45.7%)和114出来的245(46.5%),对照组中检测到。

4。结论

幽门螺旋杆菌被称为是主要的人类病原体。因为不同的影响的 幽门螺旋杆菌,需要一种准确的检测方法。目前,还没有一种方法足够灵敏和特异,可以被认为是“金标准”,所以我们不能使用一种标准进行比较;但使用的是在实践中普遍使用的,并被证明具有临床意义。我们开发了一种独特的多重PCR检测方法 幽门螺旋杆菌在内镜活检标本。

这项研究表明,生产者价格指数影响 幽门螺旋杆菌通过CLOtest的方法检测率,但不是M-PCR。这主要是考虑当选择一个诊断测试来检测的重要因素 幽门螺旋杆菌。此外,结果被重新测试由CLOtest的负面结果表明额外的46.1%,阳性病例。因此, 幽门螺旋杆菌通过电流检测方法应仔细检查,特别是谁最近一直在服用质子泵抑制剂患者,以确保结果不是假阴性。的CLOtest的是高度特异性的,但需要的细菌检测的高密度。所述M-PCR是敏感足以检测的存在 幽门螺旋杆菌尽管一个人正在对PPI治疗。

在我们的研究中,M-PCR的高检出率可以归因于我们研究的患者群。我们只测试了有症状的患者,这是更有可能的感染;作为结果的数字将在这些类型的患者高。用于在检测率和低的检测率在RUT组之间的差异的另一种来源是来自的的圆球形式形成 幽门螺旋杆菌。它可分为三个阶段:螺旋状、可活的球状体和退行性不可活的球状体。各种条件都可能诱发球虫形态,如PPI和某些抗生素[ 17]。有研究表明,蛋白质含量和遗传物质从螺旋到圆球形式在转换过程中保持不变。的圆球细胞的脲酶活性比螺旋形式下[ 18]。通过车辙鉴定球虫是困难的;然而,PCR方法被用来检测遗传物质,因为DNA保持完整。Can等的研究表明,由于未检测到突变,尿素基因区域的可靠性是由不同因素引起的[ 19]。之前的研究表明,我们的M-PCR能够检测到coccoid形式的DNA。球虫形态的毒性较弱,不易形成定植和诱发炎症。然而,它可能在感染中起作用,并被怀疑是抗菌治疗后感染复发的部分原因。当条件合适时,球虫形态可以恢复为螺旋形态,并可能恢复传染性[ 18]。

我们不排除提到的那些以外的其他药物。任何药物增加pH或抗生素可以影响生长 幽门螺旋杆菌从而可能影响结果。一个病人被CLOtest的测试呈阳性,而由M-PCR阴性。这可能有几个方面的原因差异;它可能是一个假阳性,其中CLOtest的是97%特异性或其中一个不同的脲酶生成酶的细菌或M-PCR未能检测到的细菌由于基因突变。在我们以前的研究中,所有的阳性患者免疫组化分析和CLOtest的人还通过胃标本[的M-PCR方法阳性 13]。

46.1%和52.2%,我们正M-PCR结果,PPI组和对照组,分别是类似于我们以前的研究,检测的病例52%, 幽门螺旋杆菌和另外的40%从阴性结果。我们进行了一项双盲研究,相关的M-PCR的检测率炎症评分,免疫组化结果,并CLOtest的结果。该M-PCR和CLOtest的结果不是由一个独立病理学家谁检查的组织学特征闻名。该研究的结论是,在胃活检标本的平均活性和慢性炎症分数在PCR阳性比PCR阴性显著越大,表示存在 幽门螺旋杆菌。在胃活检标本中,M-PCR检测到的 幽门螺旋杆菌在所有的阳性病例检测通过免疫组织化学分析和/或CLOtest的[ 13]。

这项研究的结果和结论与那些由Yakoob等进行了一项先前的研究相一致。研究发现在检测率没有差异通过PCR,这是在PPI的组和对照组,74%和在胃窦75%之间。它也得出结论,既RUT和组织学的诊断率降低和PCR比两者更为敏感。在从胃窦活检的PPI组,在PCR 74%,在RUT 18%,并且在组织学50%阳性。此外,PPI组中附加68%,对照44%被发现通过PCR阳性。PCR的检测率较高相比,我们的研究,这可能是由于较小的研究人群,种族背景,或患者病情加重。此外,检出率会因他们的研究中使用的一个基因与使用5个基因研究我们其实更高。该研究的结论是,使用的酸降低药物相比,PCR和组织学[降低RUT的诊断率 11]。在大多数涉及传统的PCR其他研究中,一个或两个基因进行鉴定 幽门螺旋杆菌。从因为我们的M-PCR所有其他研究我们的M-PCR不同使用5个基因,因此是更具体的 幽门螺旋杆菌。因此,它可能很难对我们的M-PCR的结果关联到传统的PCR。

检测微生物的使用PCR技术,包括 幽门螺旋杆菌,是有据可查的。与传统的PCR方法潜在的问题包括假阳性由于各种物种间污染和同源DNA序列。在我们的研究中,有非PPI组中的M-PCR和CLOtest的差别大,可能代表误报[ 20]。用于M-PCR的引物在国家生物技术信息中心的基因库中被扫描,没有找到匹配的。还有M-PCR 幽门螺旋杆菌物对19种细菌测试( 大肠杆菌,产气肠杆菌,阴沟肠杆菌,肠球菌种类, Viridians组, 铜绿假单胞菌,沙雷种类, 肺炎克雷伯菌,MRSA,乳酸菌种类, 枸橼酸种类, 脆弱拟杆菌(ATCC25285),Wolinella succinogenes的(ATCC29543),空肠弯曲菌(ATCC33291),幽门螺旋鸡白痢(ATCC52802),幽门螺旋fennelliae(ATCC35683),螺杆菌种类 (ATCC35683),幽门螺旋海尔曼螺杆菌(ATCC49286),和幽门螺杆菌蚤(ATCC49179))。19种菌均未发现标准 幽门螺旋杆菌M-PCR条带图案。还有一个内部控制,以防止误报。我们的M-PCR放大在同一时间10个的DNA片段以及将针对每个5个基因座的产生两个片段,一个内部到另一个。我们的一步法多巢式PCR的内部控制是用来排除在引物结合位点的各种物种间引起同源DNA序列的假阳性,使得比传统的PCR的M-PCR更加具体。此外,如前所述,我们的M-PCR试验,通过我们的研究证实,表明我们正M-PCR检测结果显示显著更大的平均活动和慢性炎症分数。

车辙非PPI组的检出率在研究中低。这可能归因于我们不排除像铋化合物或钙产品其他酸降低药物。虽然我们通过全面的药物审查和调查去了,患者可能没有充分披露信息。我们的检出率较其他研究低,但其他研究提到已经取得了低利率以及[ 11 12]。

总的来说,M-PCR检测了241例阳性病例。如果病人的车辙呈阴性,我们的M-PCR已经证明在诊断中是有用的 幽门螺旋杆菌进一步评估否定的结果,因为它不会受到酸降低药物。使用M-PCR的可推荐作为添加剂测试,以确认存在 幽门螺旋杆菌患者负成规。此外,对于谁需要他们的病人上经验性治疗或维持治疗医生,可以使用M-PCR检测,以便不需要患者将采取关闭一个PPI。此M-PCR测定法鉴定的显著数 幽门螺旋杆菌会不会被RUT进行检测,发现另外46.1%阳性病例的感染。我们的M-PCR检测 幽门螺旋杆菌将提高检出率,增加机会,医疗干预,并允许通过未受到PPI与许多其他诊断方法敏感,特异的方法进行治疗的患者。我们开发了一个可用的M-PCR在美国可供医生使用。

T. L. 巴索 M. J. 幽门螺杆菌在健康和疾病 消化内科 2009年 136 6 1863年 1873年 2- s2.0-65449190100 10.1053 / j.gastro.2009.01.073 Suerbaum S. 米凯蒂 P. 幽门螺杆菌感染 新英格兰医学杂志 2002年 347 15 1175 1186 2- s2.0-0037057683 10.1056 / NEJMra020542 Zsikla V. Hailemariam先 S. 鲍曼 M. Mund M. T. 绍布 N. 迈耶 R. Cathomas G。 增加的速度 幽门螺杆菌感染与慢性胃炎活检检测通过PCR 美国外科病理学杂志 2006年 三十 2 242 248 2 - s2.0 - 33645221843 10.1097 / 01.pas.0000186397.18206.1b m F。 综述文章:自然历史和流行病学 幽门螺杆菌感染 消化系统药理学和治疗,补充 2002年 16 补充1 3 15 2- s2.0-0037885299 马歇尔 B. J. 巴雷特 L. J. 普拉卡什 C。 麦卡勒姆 r·W。 Guerrant R. L. 尿素保护 幽门螺杆菌(弯曲菌)幽门从酸的杀菌效果 消化内科 1990年 99 3 697 702 2- s2.0-0025301120 Q. J.P。 大里 M. 拉克曼 l . B。 实时定量PCR检测的 幽门螺杆菌 临床微生物学杂志 2002年 40 10 3720 3728 2- s2.0-0036791234 10.1128 / JCM.40.10.3720-3728.2002 迪基 W. 肯尼 B. D. 麦康奈尔 J. B. 质子泵抑制剂对检测的影响 幽门螺杆菌在胃活检 消化系统药理学和治疗 1996年 10 3 289 293 2 - s2.0 - 0029897265 10.1111 / j.0953-0673.1996.00289.x 希林 H。 弗兰克尔 D. Shevah O. 莱文 一个。 布鲁克 R. 莫斯 S. F. 和合 Y. 主治医生 Y. 质子泵抑制剂对连续实时13C尿素呼气试验的影响 美国胃肠病学杂志 2003 98 1 46 50 2- s2.0-0037256522 10.1111 / j.1572-0241.2003.07187.x Malfertheiner P. Megraud F。 O'Morain C。 Bazzoli F。 埃尔 - 奥马尔 E. 格雷厄姆 D. 亨特 R. Rokkas T. Vakil N. 库伊佩尔斯 e . J。 在当前的管理理念 幽门螺杆菌感染:马斯特里赫特III共识报告 肠道 2007年 56 6 772 781 2- s2.0-34247844165 10.1136 / gut.2006.101634 IMS Health公司 2009年美国的销售和处方信息 2010 http://www.imshealth.com Yakoob J. Jafri W. 阿巴斯 Z. 投标 S. 伊斯兰教 M. 艾哈迈德 Z. 的各种测试的诊断率 幽门螺杆菌抗酸药物患者的感染 消化道疾病与科学 2008年 53 1 95 100 2- s2.0-37249075441 10.1007 / s10620-007-9828-Y Yakoob J. Jafri W. 投标 S. Jafri N. 阿巴斯 Z. 哈米德 S. 伊斯兰教 M. 安妮斯 K. AliShah H。 谢赫 H。 在诊断快速尿素酶试验和组织病理学中的作用 幽门螺杆菌感染在发展中国家 BMC胃肠病学 2005年 5,第38条 2- s2.0-28844437327 10.1186 / 1471-230X-5-38 魏斯 J. 曾荫权 T. K. X。 H。 基尔纳 E. E. 沃特金斯 W. 检测 幽门螺杆菌胃炎通过PCR:与炎症评分和免疫组织化学和CLOtest的相关性的调查结果 美国临床病理学杂志 2008年 129 1 89 96 2- s2.0-38449118493 10.1309 / APMPEP54G7PN958G X。 H。 曾荫权 T. 检测 幽门螺杆菌通过新颖的多重PCR检测 消化内科 2003 124 175 2 - s2.0 - 54349113382 X. W. H. J. 曾荫权 T. K. 一种新颖的比较多重PCR和组织学方法,用于诊断 幽门螺旋杆菌 消化内科 126 4 X。 H。 J. 曾荫权 R. 曾荫权 T. 检测 幽门螺杆菌从通过新颖的多重PCR检测的食物来源 中国食品安全 2008年 28 4 609 619 2 - s2.0 - 54349113382 10.1111 / j.1745-4565.2008.00135.x 安德森 L. P. 多兰 一个。 Karacan H。 Colding H。 尼尔森 H. O. Wadstrom T. 布鲁姆 J. 转型的可能的临床意义 幽门螺杆菌成球菌样的形式 斯堪的纳维亚胃肠病学杂志 2000 35 9 897 903 2- s2.0-0033808676 安德森 L. P. 拉斯穆森 L. 幽门螺杆菌-coccoid形式和生物膜形成 FEMS免疫学和医学微生物学 2009年 56 2 112 115 2- s2.0-67650754434 10.1111 / j.1574-695X.2009.00556.x 可以 F。 喀喇 C。 Dolapci 一世。 Demirbilek M. Tekeli 一个。 阿尔斯兰 H。 脲酶活性的球菌形式尿素基因测序 幽门螺旋杆菌诱导受不同因素 目前微生物 2008年 56 2 150 155 2- s2.0-38049129658 10.1007 / s00284-007-9047-Y 杉本 M. J. Y. Abudayyeh S. 霍夫曼 J. Brahem H。 铝哈提卜 K. 山冈 Y. 格雷厄姆 D. Y. 的PCR检测结果的不可靠性 幽门螺杆菌临床或环境样品中 临床微生物学杂志 2009年 47 3 738 742 2- s2.0-62749094405 10.1128 / JCM.01563-08